指挥官角色的首要获得条件是推进并完成特定的主线系列任务。指挥官并非初始即可使用的角色，其解锁与游戏的核心剧情紧密绑定。玩家需要首先完成名为第二场梦的系列任务，这是解锁指挥官控制权的关键步骤。该任务会引导玩家深入了解游戏背景，并最终赋予玩家操作指挥官的基本权限。此后，继续完成后续的内战任务至关重要，该任务将使指挥官的潜能得到进一步解放，从战甲中脱离出来，获得自由移动的能力，并开启更多的功能。这些主线任务是获得指挥官的必经之路，无法跳过。
完成上述主线任务后，玩家便可以在游戏中召唤并操作指挥官。在默认键盘设置下，按下数字键5即可在战甲与指挥官形态之间进行切换。需在仅完成第二场梦而未完成内战时，指挥官的使用存在限制，通常需要等待一个独立的能量条充能完毕后方能短暂使用其能力。而在内战任务完成后，指挥官的切换将更为自由，可以如同操作战甲一样使用WASD进行移动和跳跃，实现脱离战甲的独立行动。指挥官相关的设置与外观自定义功能，可以在个人轨道飞行器内的传识之间房间，通过与活体连接器装置互动，或在游戏内ESC菜单的指挥官选项中进行详细调整。
指挥官系统包含深度的专精成长体系，用于强化其各项能力。专精分为五个不同的学派，每个学派提供独特的被动技能和主动技能，例如增加伤害、提供生存能力或辅助团队。玩家可以通过在满级的战甲或武器上安装专精晶体，将任务中获得的额外经验值转化为专精点数，以此来解锁和升级各个学派的技能。参与夜灵平原等高阶内容击败头目获得的夜灵碎片也可以直接转化为大量专精点数，且不受每日上限限制。合理规划专精学派的升级路径，是提升指挥官战斗效能的核心。
指挥官的实战能力不仅依赖于专精，还需要配套的装备增幅器。完成内战任务后，玩家可以前往希图斯与夜羽阵营接触，获取第一把基础的增幅器。更强大的增幅器需要通过提升夜羽声望，兑换不同的棱镜、支架和曲柄部件来组装合成。一套性能优良的增幅器，结合特定的指挥官赋能，能显著提升其输出和生存能力。在高阶游戏内容中，例如对抗夜灵平原的巨型头目时，装备精良的指挥官是团队中负责快速破除敌人护盾的关键角色，其作用不可替代。
指挥官在战术层面提供了极高的灵活性。其虚空模式可以使指挥官进入隐身且无敌的状态，利用这一特性，可以在高难度任务中安全地完成诸如破解控制台、插入数据模块等交互操作，规避致命伤害。指挥官的虚空冲刺能够穿透敌人并将其击飞，在拦截类任务中能有效控制战场。指挥官与战甲之间的切换机制也能衍生出一些实用技巧，例如利用切换来重置某些状态或快速转移位置。熟练掌握指挥官的这些特性，能极大丰富玩家的战术选择，应对各种复杂战况。
