快速发展军团，基础建设是首要步骤，玩家在完成第三章主线剧情后便会解锁军团功能，之后可以选择加入一个现有军团或自行创建。加入一个活跃的大型军团对新手尤为重要，因为这类军团通常有稳定的福利体系，比如固定的军团币发放，这相当于前期发展的重要工资，可用于购买脑插、资源、信用点和舰长等关键物资。若选择创建自己的军团，则需要设定名称、代号并支付初始费用，同时建立清晰的职务架构，如军团长、副团长、人事官等，并明确各职务的权限范围，以保障军团内部管理的有效运行。
军团的核心发展与实力体现在对星系主权的争夺上，这需要通过军团战争来实现。宇宙中存在大量可被争夺的星系，它们最初由强大的原住民势力控制，夺取主权首先需要击败他们，其难度随星系富饶度提升而增加，对参战人数和舰船装备也有相应要求。在与玩家军团的战争中，规则更为复杂，战争分为上下半场，目标是摧毁对方的护盾稳定塔以最终控制星系中枢，整个过程需要周密的战术协同和舰队配合，而非个人单打独斗。积极参与此类主权战争不仅是军团获取高级矿物资源和政治筹码的关键，也是成员获取丰厚回报的主要途径。
在成功获得星系主权后，军团的经营与设施建设便成为可持续发展的支柱。军团可以在所属星系部署各类功能建筑，但所有设施部署的前提是必须先建造军团枢纽。可部署的设施包括提升资源产量的精炼厂、加速装备生产的基础装配中心、用于侦查预警的警戒塔、停泊旗舰的船坞以及影响战略机动的跳跃通道生成器等。这些设施的等级受限于星系的开发等级，而开发等级需要通过军团成员在星系内完成活动来提升。设施的升级能显著增强其功能与防御力，而当军团需要战略转移时，也可以对设施进行回收，不过该过程耗时较长且易受攻击打断。
军团的发展高度依赖成员的集体贡献与团队协作，这是一个将个体力量凝聚成整体的过程。军团系统会自动调整成员间的声望关系，形成内部绝对友好的绿色标识，而军团管理层设定的外交关系则会覆盖所有成员，统一对外显示敌对或友好目标。积极参与军团组织的各类集体活动，例如集体入侵、资源开采和设施防守，而非长期处于潜水状态，对于个人获得良好游戏体验和军团维持活力都至关重要。一个管理有序、目标明确的军团能为成员提供稳定的资源支持、战斗补损和发展指导，从而有效降低游戏后期的枯燥感与个人发展的资源压力。
